Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa5Q8C7G5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa5Q8C7G5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms