Protein–RNA interactions for Protein: Q8C145

Slc39a6, Zinc transporter ZIP6, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a6Q8C145 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc39a6Q8C145 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slc39a6Q8C145 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc39a6Q8C145 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc39a6Q8C145 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms