Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms