Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ7

Cgrrf1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cgrrf1Q8BMJ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms