Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Susd4Q8BH32 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Susd4Q8BH32 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Susd4Q8BH32 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Susd4Q8BH32 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Susd4Q8BH32 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Susd4Q8BH32 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Susd4Q8BH32 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Susd4Q8BH32 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms