Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem39bQ810L4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tmem39bQ810L4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem39bQ810L4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms