Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chn2Q80XD1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chn2Q80XD1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Chn2Q80XD1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chn2Q80XD1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chn2Q80XD1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chn2Q80XD1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chn2Q80XD1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chn2Q80XD1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms