Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp3Q7TST5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp3Q7TST5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms