Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctdp1Q7TSG2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdp1Q7TSG2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms