Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS7

Asic4, Acid-sensing ion channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic4Q7TNS7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Asic4Q7TNS7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Asic4Q7TNS7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Asic4Q7TNS7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Asic4Q7TNS7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms