Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpv1Q704Y3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trpv1Q704Y3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpv1Q704Y3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.1 ms