Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms