Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Rhox8Q6VSS7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Rhox8Q6VSS7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC41.57■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
Rhox8Q6VSS7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Rhox8Q6VSS7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Rhox8Q6VSS7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Rhox8Q6VSS7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Rhox8Q6VSS7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Rhox8Q6VSS7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Rhox8Q6VSS7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Rhox8Q6VSS7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Rhox8Q6VSS7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Rhox8Q6VSS7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Rhox8Q6VSS7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Rhox8Q6VSS7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
Rhox8Q6VSS7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Rhox8Q6VSS7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Rhox8Q6VSS7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Rhox8Q6VSS7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Rhox8Q6VSS7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Rhox8Q6VSS7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Rhox8Q6VSS7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Rhox8Q6VSS7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Rhox8Q6VSS7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Rhox8Q6VSS7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Rhox8Q6VSS7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Rhox8Q6VSS7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Rhox8Q6VSS7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Rhox8Q6VSS7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rhox8Q6VSS7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Rhox8Q6VSS7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Rhox8Q6VSS7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Rhox8Q6VSS7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Rhox8Q6VSS7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Rhox8Q6VSS7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Rhox8Q6VSS7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Rhox8Q6VSS7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rhox8Q6VSS7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rhox8Q6VSS7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rhox8Q6VSS7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
Rhox8Q6VSS7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Rhox8Q6VSS7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Rhox8Q6VSS7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms