Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC9

Zfp341, Zinc finger protein 341, mousemouse

Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp341Q6PGC9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp341Q6PGC9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp341Q6PGC9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp341Q6PGC9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp341Q6PGC9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp341Q6PGC9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp341Q6PGC9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms