Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms