Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB44

Ptpn23, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23, mousemouse

Predictions only

Length 1,692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn23Q6PB44 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Ptpn23Q6PB44 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Ptpn23Q6PB44 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28,95■■■□□ 2,23
Ptpn23Q6PB44 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Ptpn23Q6PB44 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28,89■■■□□ 2,21
Ptpn23Q6PB44 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Ptpn23Q6PB44 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Ptpn23Q6PB44 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,9 ms