Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam222bQ6P539 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam222bQ6P539 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms