Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rad17Q6NXW6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rad17Q6NXW6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rad17Q6NXW6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms