Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cpsf6Q6NVF9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpsf6Q6NVF9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf6Q6NVF9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 593.2 ms