Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frem2Q6NVD0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Frem2Q6NVD0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frem2Q6NVD0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frem2Q6NVD0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frem2Q6NVD0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frem2Q6NVD0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Frem2Q6NVD0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frem2Q6NVD0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frem2Q6NVD0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Frem2Q6NVD0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frem2Q6NVD0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frem2Q6NVD0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frem2Q6NVD0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frem2Q6NVD0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frem2Q6NVD0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Frem2Q6NVD0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms