Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt39Q6IFX4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt39Q6IFX4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms