Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbf1Q6DFZ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbf1Q6DFZ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbf1Q6DFZ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbf1Q6DFZ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbf1Q6DFZ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbf1Q6DFZ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbf1Q6DFZ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbf1Q6DFZ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbf1Q6DFZ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gbf1Q6DFZ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gbf1Q6DFZ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Gbf1Q6DFZ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gbf1Q6DFZ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbf1Q6DFZ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbf1Q6DFZ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbf1Q6DFZ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbf1Q6DFZ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbf1Q6DFZ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbf1Q6DFZ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbf1Q6DFZ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbf1Q6DFZ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbf1Q6DFZ1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms