Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
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Pdzrn3Q69ZS0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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Pdzrn3Q69ZS0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pdzrn3Q69ZS0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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Pdzrn3Q69ZS0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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Pdzrn3Q69ZS0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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Pdzrn3Q69ZS0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdzrn3Q69ZS0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
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Pdzrn3Q69ZS0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdzrn3Q69ZS0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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