Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Zeb1Q64318 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Zeb1Q64318 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Zeb1Q64318 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Zeb1Q64318 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms