Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sp4Q62445 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sp4Q62445 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms