Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

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Length 760 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4aQ62178 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4aQ62178 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sema4aQ62178 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema4aQ62178 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema4aQ62178 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema4aQ62178 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4aQ62178 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4aQ62178 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms