Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctnna2Q61301 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnna2Q61301 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna2Q61301 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms