Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna1Q60960 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna1Q60960 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kpna1Q60960 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms