Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp20Q5XG71 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp20Q5XG71 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.2 ms