Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E0

Lhfpl4, LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl4Q5U4E0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhfpl4Q5U4E0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhfpl4Q5U4E0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhfpl4Q5U4E0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhfpl4Q5U4E0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lhfpl4Q5U4E0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lhfpl4Q5U4E0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lhfpl4Q5U4E0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhfpl4Q5U4E0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhfpl4Q5U4E0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms