Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NotoQ5TIS6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms