Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctc1Q5SUQ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctc1Q5SUQ9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms