Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sco1Q5SUC9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sco1Q5SUC9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms