Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttf2Q5NC05 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttf2Q5NC05 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ttf2Q5NC05 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms