Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc1cQ4KL78 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Khdc1cQ4KL78 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms