Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim80Q3V061 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim80Q3V061 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms