Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm12888Q3UW77 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm12888Q3UW77 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms