Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ41

Tmprss11a, Transmembrane protease serine 11A, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11aQ3UQ41 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11aQ3UQ41 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11aQ3UQ41 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11aQ3UQ41 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11aQ3UQ41 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11aQ3UQ41 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11aQ3UQ41 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmprss11aQ3UQ41 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11aQ3UQ41 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms