Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep63Q3UPP8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep63Q3UPP8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep63Q3UPP8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep63Q3UPP8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep63Q3UPP8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep63Q3UPP8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep63Q3UPP8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep63Q3UPP8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep63Q3UPP8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep63Q3UPP8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep63Q3UPP8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep63Q3UPP8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms