Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp30Q3UN04 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp30Q3UN04 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms