Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Edc4Q3UJB9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Edc4Q3UJB9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Edc4Q3UJB9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
Edc4Q3UJB9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms