Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitpnm3Q3UHE1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pitpnm3Q3UHE1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms