Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mcrip1Q3UGS4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mcrip1Q3UGS4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mcrip1Q3UGS4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms