Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Garem1Q3UFT3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Garem1Q3UFT3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms