Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenplQ3U3S3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CenplQ3U3S3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CenplQ3U3S3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms