Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tbc1d2bQ3U0J8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tbc1d2bQ3U0J8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tbc1d2bQ3U0J8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms