Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hace1Q3U0D9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms