Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp13a5Q3TYU2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp13a5Q3TYU2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms