Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cers3Q1A3B0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cers3Q1A3B0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cers3Q1A3B0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms