Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc7a1Q09143 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc7a1Q09143 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc7a1Q09143 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms